过去10年间，单细胞蛋白质组学的发展前景一直是蛋白质组领域热议的话题。单细胞蛋白质组学质谱（SCoPE-MS）是近几年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法，这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞。
最新的Nature Methods文章Defining the carrier proteome limit for single-cell proteomics开发的程序SCPComponsion能够对单细胞蛋白质组学质谱进行快速的质量控制分析。
下载（仅支持Windows）：https://www.github.com/scp-ms/SCPCompanion
官方教程：
目前来说程序仅支持赛默飞产生的raw文件格式数据，但是新的SCoPE-MS方法增加了SCP-MS的分析深度，大约可以增加到约5000个蛋白质。
使用说明：
分析完成后可以对结果可视化：
结果数据：
参考资料：
1.Cheung, T.K., Lee, CY., Bayer, F.P. et al. Defining the carrier proteome limit for single-cell proteomics. Nat Methods (2020).
2.https://github.com/scp-ms/SCPCompanionSource
3.https://www.github.com/scp-ms/SCPCompanion
