iSwathX是一个基于R shiny的DIA Library处理和DIA下游数据分析的软件,现在已经更新到2.0版本,增加了很多个性化的数据处理,极大的方便DIA数据分析,尤其在Library处理上,囊括了Library转化、比较、合并、可视化等一系列的功能,界面如下:

主要的特色功能:

1)处理、合并两个library(不同软件处理的Libray的合并,如OpenSWATh、PeakView、Skyline、Spectronaut,这个功能是相当不错的,如果自己写代码需要费很大时间,包括处理各个Library的格式,RT对齐等等)以及Library的可视化,Library依据条件过滤,Library之间的比较等

2)多线程处理多个Library的合并(最多支持4个)

3)DIA下游数据分析以及可视化操作(包括了常见的下游数据可视化,如:点图、分布曲线等)

下载:https://github.com/znoor/iSwathX

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下载完成后,解压到目录,然后用Rstudio打开ui.R文件,点击Run App即可

参考资料:

1.https://github.com/znoor/iSwathX