Pathview是一个用于整合组学表达数据并呈现在KEGG通路中的一个R包。先下载KEGG官网上的通路图，然后整合输入数据对通路图中的每个基因绘制热图，进行个性化处理。官方提供了Web（https://pathview.uncc.edu/）也有对应的R包，KEGG结合基因表达信息的整合分析可以说是非常方便。
# R包
BiocManager::install("pathview")在线版也是非常方便，分了三大块，Input&Output、Graphics和Coloration，此处用示例1（Example 1）做演示：
1.Input&Output：指定输入文件（上传）、输出
Gene数据格式（只能上传txt或者csv文件）如下：
复合数据（Compound Data，只能上传txt或者csv文件），接受像代谢、药物、小分子数据等：
2.Graphics制定图像布局和图例属性
3.Coloration调整颜色
以上三步都设置好后点击Submit即可。
完成后，点击Analysis Results and logs查看和下载结果。
KEGG分析利器，推荐！
参考资料：
1.https://pathview.uncc.edu/
