pFind studio的主要核心是 pFind(文章刊登在了NBT,算是生信领域的顶级期刊)。用官方介绍来说,pFind是目前国内唯一的具有自主知识产权的蛋白质鉴定引擎,是由中科院计算所pFind团队迟浩老师主导开发了蛋白质鉴定引擎pFind,以及一系列质谱数据分析软件:

软件描述
pFindPeptide and protein identification from tandem mass spectra.
pLinkChemically cross-linked proteins or protein complexes analysis using mass spectrometry.
pGlycoIntact glycopeptides analysis using mass spectrometry.
pNovoDe novo sequencing of peptides from MS/MS data without any databases.
pTopIntact protein analysis using mass spectrometry.
pQuantPeptide and protein quantitation analysis.
pAnnoProteogenomic analysis tools based on the MS/MS searching results.
pLabelMass spectral peak labeling tool developed for proteomics research.
pXtractText-plain spectra extraction from vendor’s MS/MS data formats.
pParseExtraction and Caliburation of monoisotopic peaks of precursors in MS/MS datasets.

pFind工作流:

下载:访问连接( 2020-01-02 )

目前pFind仅仅支持Windows系统, pFind studio 整合了上面提到的诸多小工具,并集成了一个GUI可视化操作界面,极大的降低的操作门槛:

PFind目前是免费的,需要邮件pfind@ict.ac.cn申请License, pFind团队很快会回复的。

本来想简单写一下其操作教程,发现迟浩老师们的手册已经很完善了,建议操作参考官方手册:

参考资料:

1.http://pfind.ict.ac.cn/software/pFind3/index.html