Skyline是一个免费开放源码SRM、MRM、PRM、DIA/SWATH 和DDA,使用MS1定量方法并分析得到的质谱仪数据的windows软件。

官方中文教程目前有以下几个模块:

1)靶向方法编辑

教程地址:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/MethodEdit_2_6_zh-CHS.pdf

2)靶向方法优化

教程地址: https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/MethodRefine-1_4_zh-CHS.pdf

3)分析分类研究的数据

教程地址:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/GroupedStudies1-3_1_zh-CHS.pdf

4)处理已有定量实验数据

教程地址:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/ExistingQuant-1_4_zh-CHS.pdf

5)小分子目标

教程地址:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/SmallMolecule-3_1_zh-CHS.pdf

6)MS1 全扫描筛选

教程地址:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/MS1Filtering-2_5_zh-CHS.pdf

7)靶向 MS/MS (PRM)

教程地址:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/TargetedMSMS-2_5_zh-CHS.pdf

8)非数据依赖型采集

教程下载:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/DIA-2_6_zh-CHS.pdf

9)iRT 保留时间预测

教程下载:https://skyline.ms/labkey/_webdav/home/software/Skyline/%40files/tutorials/Chinese/iRT-2_5_zh-CHS.pdf

参考文章:

1.https://skyline.ms/wiki/home/software/Skyline/page.view?name=tutorials_zh