1.常用数据库

NCBI：美国国立生物技术信息中心综合数据库

https://www.ncbi.nlm.nih.gov

Ensembl：脊椎动物和模式生物的基因组数据库

http://asia.ensembl.org/index.html

UCSC：模式生物基因组数据库

http://genome.ucsc.edu

（推荐）GeneCards：人类基因综合数据库

https://www.genecards.org

（推荐 ）欧洲生物信息研究所出品

https://www.ebi.ac.uk

2.核苷酸序列数据库

GenBank：所有已知的核苷酸序列与蛋白质序列

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/

EMBL数据库

http://asia.ensembl.org/index.html

DDBJ Center：来自日本的DNA序列的核酸序列数据库

https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html

3.RNA序列数据库

Rfam：非编码RNA家族数据库

https://rfam.xfam.org

lncRNABase：提供miRNA调控长非编码RNA(lncRNA)、假基因(pseudogene)和环状RNA(circRNA)的互作信息和ceRNA调控网络

http://starbase.sysu.edu.cn

LNCipedia: 对人类的长链非编码RNA的序列和结构全面的注释

https://lncipedia.org

ChIPBase:提供长链非编码RNA的表达图谱和转录调控的全面鉴定和注释。整合了高通量的RNA-seq鉴定的lncRNA及其表达图谱和ChIP-Seq实验技术鉴定的转录因子结合位点

http://rna.sysu.edu.cn/chipbase/

oncoNcRNA:研究各类非编码RNA(lncRNA，miRNA， piRNA， tRNA和snoRNA等)在肿瘤中的表达模式和作用。这平台包含了64种癌症类型(>20000肿瘤样本和>900种癌症细胞系)的各类非编码RNA的表达和拷贝数变化数据（SCNA）

http://rna.sysu.edu.cn

lncRNAdb: 提供有生物学功能的长链非编码RNA的全面注释

www.lncrnadb.org

LncRNADisease: 提供了文献报道的疾病相关的长链非编码RNA的注释

http://www.cuilab.cn/lncrnadisease

NONCODE：提供对长链非编码RNA的全面注释，包括表达和该团队开发的ncFANs计算机软件预测的lncRNA功能

http://www.noncode.org

参考文章：

1.https://baike.baidu.com/item/RNA序列数据库/22099050

2.https://baike.baidu.com/item/常用核酸序列数据库/3768222?fr=aladdin

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