R绘图中，ggstatsplot包可谓是科研神器，可以绘制很多复杂的高大上的统计图形。

主要功能：

函数图形Description
ggbetweenstatsviolin plotsfor comparisons between groups/conditions
ggwithinstatsviolin plotsfor comparisons within groups/conditions
gghistostatshistogramsfor distribution about numeric variable
ggdotplotstatsdot plots/chartsfor distribution about labeled numeric variable
ggpiestatspie chartsfor categorical data
ggbarstatsbar chartsfor categorical data
ggscatterstatsscatterplotsfor correlations between two variables
ggcorrmatcorrelation matricesfor correlations between multiple variables
ggcoefstatsdot-and-whisker plotsfor regression models and meta-analysis

此包功能强大，具体不详细介绍，大家可以去官网查看。最近遇到一个问题，就是我想指定 ggstatsplot 绘制的小提琴颜色，但是默认给的参数貌似没有修改点的颜色。默认图如下：


# 加载必备的绘图包
set.seed(2020)
library(ggstatsplot)
library(ggplot2)
library(ggthemes)

# 绘图
ggbetweenstats(
  data = ToothGrowth,       # 采用系统牙齿的数据
  x = supp,      
  y = len,      
  notch = T,                # 盒状图显示缺口
  mean.ci = T,              # 显示均值的置信区间
  k = 2,                    # 结果保留几位小数
  outlier.tagging = TRUE,   # 是否需要标记离群值
  outlier.label = dose,     # 用于离群值标记的变量
  xlab = "Supplement type", # X轴标签
  ylab = "Tooth length",    # Y轴标签
  title = "The Effect of Vitamin C on Tooth Growth",
  ggtheme = theme_few(),    # 绘图主题，可以从ggthemes中选择，也可以自定义
  ggstatsplot.layer = FALSE,# 关闭 `ggstatsplot` 主题图层
  package = "wesanderson",  # 选择用于调色板的R包
  palette = "Darjeeling1",  # 调色板
  messages = FALSE          
)

由于 ggstatsplot 是ggplot2的扩展包，我们需要修改点的颜色，可以像修改ggplot2点的颜色一样指定，利用scale_colour_manual来改变其颜色，示例如下：

# 加载必备的绘图包
set.seed(2020)
library(ggstatsplot)
library(ggplot2)
library(ggthemes)

# 绘图
ggbetweenstats(
  data = ToothGrowth,       # 采用系统牙齿的数据
  x = supp,      
  y = len,      
  notch = T,                # 盒状图显示缺口
  mean.ci = T,              # 显示均值的置信区间
  k = 2,                    # 结果保留几位小数
  outlier.tagging = TRUE,   # 是否需要标记离群值
  outlier.label = dose,     # 用于离群值标记的变量
  xlab = "Supplement type", # X轴标签
  ylab = "Tooth length",    # Y轴标签
  title = "The Effect of Vitamin C on Tooth Growth",
  ggtheme = theme_few(),    # 绘图主题，可以从ggthemes中选择，也可以自定义
  ggstatsplot.layer = FALSE,# 关闭 `ggstatsplot` 主题图层
  package = "wesanderson",  # 选择用于调色板的R包
  palette = "Darjeeling1",  # 调色板
  messages = FALSE          
) + 
################划重点################
  scale_colour_manual(values = c("VC" = "blue", "OJ"= "black")) # 改变点颜色

对于ggplot2的所有扩展系列或者基于ggplot2开发的包都可以利用ggplot2相关参数进行调整。

参考文章：

1.https://github.com/IndrajeetPatil/ggstatsplot

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